Bonsoir,
Mon hypothèse, c'est que la mise à jour ne fait qu'écraser l'existant sans se soucier de réinitialiser entièrement tous les paramètres de la chaine. Ce qui expliquerait que des chaines ne fonctionnent pas à cause d'un paramètre non remis à blanc ou zéro, paramètres subsistant de l'ancienne chaine ...
Les anciennes chaines qui ne subissent pas de mise à jour subsistent.
Le programmeur du logiciel n'a vraisemblablement pas jugé utile d'effacer les anciennes chaines avant de les recharger.
On peut penser qu'il n'a pas jugé utile de mettre à jour une valeur qui est mise par défaut, ce qui fait que l'ancienne valeur si elle est différente de la valeur par défaut ne sera pas écrasée etc...
Vider la configuration de toutes les anciennes valeurs avant lancer la mise à jour est finalement une précaution utile à prendre à chaque mise à jour.
Courage !